产品特点
2×SYBR qPCR Mix 是专用于染料法实时荧光定量 PCR 的预混体系,包含热启动 Taq DNA Polymerase 、PCR 扩增优化的稳定剂和增强剂、dNTPs 、SYBR Green I 荧光染料、 Mg2+等,操作简便,应用于基因组 DNA 靶序列和 RNA 反转录后 cDNA 靶序列的定量检 测。该试剂盒确保 DNA 或 cDNA 模板的准确定量,适用于各种类型荧光定量 PCR 仪。
它具有下列特点:
1. 高灵敏度:荧光染料 SYBR Green I 可以与所有的双链 DNA 结合,可以精-确定量 低拷贝模板。
2. 高特异性:独特的 PCR 缓冲体系与热启动酶的组合,有效抑制非特异性的 PCR 扩增。
成分规格
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产品名称
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规格
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2× SYBR qPCR Mix
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1ml/5×1ml
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50×ROX Reference Dye I
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40μl/200μl
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50×ROX Reference Dye II
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40μl/200μl
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-20℃可长期保存12个月
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本产品仅供科研使用 ,不得用于其它用途
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使用方法
(注 意: 以下举例为常规qPCR 反应体系和反应程序,实际操作中应根据模板、 引物结构和目的片 段大小不同进行相应的改进和优化)
1. 将DNA模板、引物、2×SYBR qPCR Mix、50×ROX Reference Dye I/II溶解并置于冰上备用。
2. 根据以下表格配置反应体系,总体积为20 μl。
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试剂
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用量
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终浓度
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2 ×SYBR qPCR Mix
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10μl
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1×
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正义引物 (10μM)
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0.5μl
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0.25μM
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反义引物 (10μM)
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0.5μl
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0.25μM
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模板DNA
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xμl
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/
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50× ROX Reference Dye I or II
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0.4μl
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1×
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ddH2O
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Up to 20μl
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/
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(注 意:
a. 通常引物浓度以 0.25 μM 可以得到较好结果,可以终浓度 0.1-1.0 μM 作为设定范围的参 考。扩增效率不高的情况下,可提高引物的浓度;发生非特异性反应时,可降低引物浓度,由此优化 反应体系 ;
b. 通常 DNA 模板的量以 10-100 ng 基因组 DNA 或 1-10 ng cDNA 为参照, 因不同物种的 模板中含有的目的基因拷贝数不同,可对模板进行梯度稀释, 以确定佳的模板使用量。)
需使用 ROX Reference Dye I 的机型:
ABI Prism5700、7000、7300、7700、7900、7900HT、 7900HT Fast 、Step-One 、Step-One Plus。
需使用 ROX Reference Dye II 的机型:
ABI Prism 7500/7500Fast 、ViiA7, Stratagene MX4000/MX3005P/MX3000P。
不需要使用 ROX 的机型:
Bio-Rad CFX96, CFX384, iCycler iQ, iQ5, MyiQ, MiniOpticon, Opticon, Opticon 2, Chromo4; Cepheid SmartCycler; Eppendorf Mastercycler ep realplex, realplex 2 s; Illumina Eco qPCR; Qiagen/Corbett Rotor-Gene Q, Rotor-Gene 3000, Rotor-Gene 6000; Roche Applied Science LightCycler 480; Thermo Scientific PikoReal Cycler。
3. qPCR反应程序,两步法PCR:
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过程
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温度
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时间
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预变性
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95℃
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3min
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35-40cycles
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变性
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95℃
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15sec
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退火/延伸
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60℃
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10-30sec
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熔解曲线分析,按仪器推荐程序
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注 意:
a. 建议采用两步法 PCR 反应程序,若因使用 Tm 值较低的引物等原因,得不到良好的实验 结果时,可尝试进行三步法 PCR 扩增,退火温度请以56℃-64℃的范围作为设定参考;b. 融解曲线分 析请以所使用的荧光定量 PCR 仪推荐的程序进行设定。)
4. 反应结束后确认荧光定量PCR的扩增曲线和融解曲线,进行PCR定量制作标准曲线等。
引物设计原则
1. PCR扩增产物长度: 80~150bp较为合适(可以至300bp)。
2. 引物GC含量:40~60%(45~55%理想)。
3. Tm 值:60~65℃ , 正反引物的Tm值不能相差太大。
4. 引物序列:A 、G 、C 、T 整体分布尽量均匀,不要有部分的GC rich或AT rich(特别 是 3’端)。避开T/C(Polypyrimidine)或A/G(Polypurine)的连续结构。
5. 3’末端序列:避免GC rich或AT rich。3’端碱基好为G或C。尽量避免3’末端碱基为 T。
6. 互补序列:避免引物二聚体的情况。两条引物间的3’末端避开有2个碱基以上的互补序列。